Der Grund für die hohe Biodiversität (Artenvielfalt) im Entlebuch ist das eng verzahnte Mosaik an unterschiedlichsten Lebensräumen, das in der Region vielen Tieren und Pflanzen ein Zuhause bietet: So sind auf kleinstem Raum sehr trockene und basische Karstlebensräume mit sehr nassen und sauren Moorlebensräumen verwoben. Dazu bietet das Entlebuch zahlreiche spezielle Formen von Wäldern, wie zum Beispiel in der Napfregion. In den höheren Lagen finden sich Magerwiesen und –weiden, die besonders artenreich sind, da sie extensiv bewirtschaftet werden.